ファイルを塊でbase64エンコードすることは可能ですか？

うーん、Base64変換を自分で書いたのであれば、明らかなことに気づいたはずです.3オクテットの各シーケンスは、base64では4文字で表されます。

したがって、base64データを4文字の倍数に分割することができ、これらのチャンクを元のビットに戻すことができます。

キャラクターファイルとバイトファイルがAS/400上でどのように扱われるかはわかりませんが、両方の概念がある場合は非常に簡単です。

• 各行の長さに制限のあるテキストファイルですか？
• テキストファイルは行指向ですか、それとも単に文字ストリームですか？
• 1バイトに何ビットありますか？
• 最後に埋め込まれたバイトファイルなので、ディスクセクタ全体にまたがるファイルしか作成できません。

これらすべての質問に答えることができれば、どんな困難が残っていますか？

任意のバイトストリームをチャンクに分割するのは簡単な作業です。

任意のバイトのチャンクを問題なくbase64することができます。

あなたが直面している問題は、チャンク（3バイトの倍数）に特定の要件を置かない限り、base64でエンコードされたチャンクのシーケンスが実際の出力と異なることです。

C＃では、これはあなたがそれをゆっくりと行うことができる1つ（ちょっとした）方法です。実行は実際にはstring.Concatが呼び出されるまで延期されるので、チャンクされた文字列で必要な処理を行うことができます。 （これをLINQPadに接続すると出力が表示されます）

void Main()
{
    var data = "lorum ipsum etc lol this is an example!!";
    var bytes = Encoding.ASCII.GetBytes(data);
    var testFinal = Convert.ToBase64String(bytes);

    var chunkedBytes = bytes.Chunk(3);
    var base64chunks = chunkedBytes.Select(i => Convert.ToBase64String(i.ToArray()));
    var final = string.Concat(base64chunks);

    testFinal.Dump(); //出力
    final.Dump(); //出力
}
public static class Extensions
{
    public static IEnumerable> Chunk(this IEnumerable list, int chunkSize)
    {
        while(list.Take(1).Count() > 0)
        {
            yield return list.Take(chunkSize);
            list = list.Skip(chunkSize);
        }
    }
}

出力

bG9ydW0gaXBzdW0gZXRjIGxvbCB0aGlzIGlzIGFuIGV4YW1wbGUhIQ==
bG9ydW0gaXBzdW0gZXRjIGxvbCB0aGlzIGlzIGFuIGV4YW1wbGUhIQ==